第二天，光辉独自前往海妖一族的星域与海妖一族的高层进行的密谈，随后光辉又前往银河系联邦首府与次席执行官李铭圣进行的交谈，随后联邦开始加强海妖一族星域附近的防御和银河系所有行政星的防御，并建造了大量的侦查哨所，遍布整个银河系，军工厂同样在加足马力制作战舰。虽然知道第二十军团不会马上过来，但是令宇宙战舰少女们想不到的是，这一等就是三年。在这三年中，联邦将侦查哨所布满了整个银河系，数量庞大的防御堡垒布置在了行政星附近。而新式战舰建造了一亿艘，而老式战舰也有十亿艘。
三年后，学院星已经毕业了三批共有三万的学员，这三万学员分散到各个军区继续进行教学。很快联邦就有了数量庞大的对宇宙恶魔的战舰指挥官。
这一天，在学员星上，一号的内部空间里，两拨共12艘战舰正在空中互相对峙。其中一方后排为列克星敦，萨拉托加，南达科他。前排为克利夫兰，威奇塔，海伦娜。另一方后排为瑞鹤，翔鹤，祥凤。前排为高雄，爱宕，夕立。
在所有的宇宙战舰少女改造完毕后，一号忽然告诉大家，在改造的时候加入了组队系统，所以为了测试这个系统，便有了前面的情况。
其中后排主力部队列克星敦和萨拉托加的改造数据是一样的：航空母舰型：舰长从100公里宽30公里，增加到了200公里长，60公里宽。取消了原本配有的小型战舰，增加了百米长次级幽能战机，次级幽能战机搭配了近战和远程的所有装备。从原来的1000架增加到了5000架，增加到了500个战机发射口，增加到了50门300米口径次级幽能炮，500门次级幽能近战防空炮。核心能源也转变成了次级幽能。
列克星敦的技能为：1：姐妹同心：与萨拉托加同在一个舰队时，所有伤害提升35。2：舰队空母：战斗中，为先锋部队提高20伤害，持续到战斗结束（可与其他buff叠加）。
萨拉托加的技能为：1：姐妹同心：与列克星敦同在一个舰队时，所有伤害提升35。2：舰队空母：战斗中，为先锋部队提高20伤害，持续到战斗结束（可与其他buff叠加）。
南达科他的改造数据为：战列舰型：舰长由100公里宽30公里，增加到200公里宽60公里。由4门4连460米口径主炮更换为8门4连1公里口径次级幽能主炮，由50门155米口径副炮更换为300米口径的次级幽能副炮。增加到500门次级幽能防空炮。核心能源也转变成了次级幽能。
南达科他的技能为：1：最强之盾：使用技能后，护盾强度上限增加5倍，承受组队舰队受到的100伤害，战斗中可随时开启和关闭，受到攻击后，即使关闭后再次开启，护盾强度也不恢复。脱离战斗后即可重置。2：重点打击：主炮射击时有25的概率造成2倍伤害。
前排先锋部队克利夫兰和海伦娜的改造数据是一样的：轻型巡洋舰型：舰长由30公里宽8公里增加到60公里宽16公里，由两门150米口径单主炮变更为4门300米口径的2连装次级幽能主炮，由10门20米口径副炮更换为20门40米口径的次级幽能副炮，由50个光子鱼雷发射口增加为100个次级幽能光子鱼类发射口，由500门防空炮增加为1000门次级幽能防空炮。核心能源同样更换为次级幽能。
其中克利夫兰的技能为：1：强袭号令：进入战斗后，提升组队全体战舰25伤害。（可与其他buff叠加。）2：防空模式：开启防空模式后，防空炮火力提高100，主炮火力降低50。3：全弹发射：主炮每开火10次，便会触发，进行一次不消耗能量弹药的全弹发射。（包括光子鱼类和防空炮。）
海伦娜的技能为：1：雷达扫描：对指定区域范围内的敌方战舰进行扫描，使其受到的伤害提高40。2：全弹发射：主炮每开火10次，便会触发，进行一次不消耗能量弹药的全弹发射。（包括光子鱼类和防空炮。）
威奇塔的改造数据为:重型巡洋舰型：舰长由60公里宽20公里增加到120公里宽40公里，由6门3连203米口径主炮更换为12门3连500米口径次级幽能主炮，由20门50米口径副炮更换为40门100米口径副炮，由200门防空炮更换为400门次级幽能防空炮，核心能源同样更换为次级幽能。
威奇塔的技能为：1：炮术指挥官：增加组队战舰主炮伤害20。（可与其他buff叠加。）2：主炮连射：主炮攻击时有30概率额外发射一组炮弹。3：全弹发射：主炮每开火8次，便会触发，进行一次不消耗能量弹药的全弹发射。（包括防空炮。）
另一方的瑞鹤，翔鹤，祥凤同样为航空母舰，其改造资料同其余航空母舰一样。
其中翔鹤的技能为：1：不幸的姐姐：与瑞鹤同在一个舰队时，自身伤害提高30，受到的伤害提高10。2：鹤之加护：使用技能后，队伍中全员伤害提高10受到伤害降低10。
瑞鹤的技能为：1：幸运的妹妹：与翔鹤同在一个舰队时，自身伤害提高20，受到的伤害降低20。2：鹤之奋进：使用技能后，队伍中全员伤害提高20。
祥凤的技能为：1：支援空母：使用技能后，为先锋部队回复100的护盾能量。（每场战斗只能使用一次。）2：制空支援：进入战斗后，为本队伍中其他航母提高20伤害。
前锋部队中，高雄和爱宕的改造资料与威奇塔相同。
其中高雄的技能为：1：姐妹同心：与爱宕同在一