俞咨皋当初跟着南居益打赢了荷兰人的舰队之后，福建水师损失巨大，却没有得到应有的补充。
等到南居益离任之后，郑芝龙迅速强势崛起，在天启六年冬的一次海战之中，俞咨皋所带水师被郑芝龙打得全军覆没，而身为总兵官的俞咨皋几乎是孤身逃回。
俞咨皋逃回来之后，随即被逮捕，没过多久，就被朝廷下令就地斩首示众。
一个身经百战的总兵官，而且还是俞大猷这种大功臣的儿子，因为一场失败，说斩首就斩首了。
虽然当时的明朝已经是算是末世气象了，但仍可从中见出当时大明朝廷的权威之重。
如今站立在大殿之中文官前列的新任兵部尚书南居益，听崇祯皇帝说完了这话，连忙出列上前，跪倒在地，叩首说道：
“陛下圣明，令臣感奋！今日朝廷有此海军之设，更亲耳听闻陛下此言，臣心中多年夙愿得尝！
“我大明得遇陛下这般圣主，重现太祖成祖当年之盛世局面指日可待！”
兵部尚书南居益跪在地上说出这番话，身后站立的内阁首辅李国鐠也当即出列，撩袍跪地，山呼万岁。
李国鐠这么一来，殿中文武群臣自然也不能站着，当下一个个跪在地上大礼参拜，然后山呼万岁一番。
等到群臣参拜颂圣一番完毕，崇祯皇帝也不说平身免礼的话，直接说道：
“边军、内卫、近卫、海军之外，朕所谓今后之五军都督府中，尚有一后备军都督府！
“边军、内卫、近卫、海军之属，皆常备之军也！而此等经制常备之军以外，似各地不领朝廷粮饷之乡勇、团练、民壮之设，皆为后备之军也！从今而后，悉归后备军都督府统一登记调度，以备不时之需！”
说完了这话，崇祯皇帝略作停顿，然后对跪在殿中的群臣说道：“朕今日与卿等所说，只是一个大略。除此之外，至于此五军都督府该当设于何地，该有何种职司，各个都督府之左右都督、都督同知、都督佥事等大员，该有何人充任，等等事宜，皆由军机大臣与兵部以及现有五军都督府诸卿拟定，尔后呈朕，由朕与内阁诸卿共议也！”
崇祯皇帝话音刚落，突听群臣之中有个苍老而低沉的声音说道：“启奏陛下！五军都督府原有南北两京之分设，此番朝廷以此新设之五军取代京师现有之五军，似南京之五军都督府，又该当如何安置？”
光听声音，崇祯皇帝就知道是英国公张惟贤了。
张惟贤说完了这话，看见皇帝沉吟不语，当下接着说道：“我大明朝幅员辽阔，南北之间远者相隔数千乃至万里之遥，祖宗当年有南北五军都督府之分设，其中自有道理。
“方才老臣听闻陛下之言，对新五军之设，并无不同之意见，只是此端尚需陛下深思而熟虑！”